Насчет фанеры - пока нет желания что-то менять там. Думаю как потеплеет поснимать всю обшивку багажника - может где по креплению проблемы есть.
П.С. Наткнулся на аналогичную тему на российском форуме, тоже обсуждали провал крышки с одной стороны (и у всех справа). В общем косяки сборки. Можно разве что пройтись каким-нибудь уплотнителем, а потом обнять и простить.