Может диодный мост, в общем, смотреть надо.
Что касается нагрузок, то лучше всего перед выключением зажигания все выключить - еще и замок зажигания дольше проживет. А после заводки не сразу врубать все, а спустя хотя бы минуту. Ну или подзаряжать аккумулятор регулярно.
Но это ИМХО, само по себе это не должно приводить к выходу из строя чего бы то ни было, просто увеличит вероятность.